家自然科学基金重点课题：

中药色谱指纹图谱有效成分分析方法研究(编号:20235020)，2003-2006.

科技部国际科技合作项目：

基于系统生物学的中药现代化基础研究(编号:2007DFA40680)，2008-2010.

基于代谢组学的中药活性成分的分析与评价研究(编号:2007DFA41090)，2006-2008.

国家自然科学基金面上项目：

新型羧基羟肟酸类化合物的设计、合成与性能(编号：20876180)，2009-2011.

高维数据的多元分辨法及其在中草药分析中的应用（编号：29735150)，1999-2001.

分析化学中数据发掘的化学计量学新方法研究(编号:20175036)，2002-2004.

国家药典委员会委托研究项目：

全国鱼腥草注射液指纹图谱研究及国家标准制定，2002-2004.

香港合作项目：

化学计量学的高维数据解析方法及其在中药指纹图谱定性定量剖析研究，2000-2002.

联用色谱在中草药分析中的应用研究，1999-2002.